1:

boxZusammenfassung.AppendText(boxThema.Text + Environment.NewLine); //Hier sollte aber die Hauptbox einfach leer sein                    

1:

boxZusammenfassung.Text = boxZusammenfassung.Text.Replace("%THEMA%", boxThema.Text + Environment.NewLine);                    

1:

boxZusammenfassung.AppendText(String.Format("{0}{1}{1}{1}", boxThema.Text, Environment.NewLine));                    

1:
2:

string s = String.IsNullOrEmpty(boxThema.Text) ? "" : boxThema.Text + Environment.NewLine;
boxZusammenfassung.AppendText(s);                    

1:
2:
3:
4:
5:
6:
7:
8:
9:
10:
11:
12:
13:
14:
15:
16:
17:
18:
19:
20:
21:
22:
23:
24:
25:
26:
27:
28:

StringBuilder stringBuilder = new StringBuilder();

// Alle Zeilen durchgehen und prüfen, ob zwei leere Zeilen hintereinander kommen
// Wenn nein, füge sie zum StringBuilder hinzu

string lastLine = "blabla"; // Darf nicht leer sein, sonst evtl Leerzeile am Anfang des Textes

foreach (string line in boxZusammenfassung.Lines)
{
  string s = line.Trim(); // Evtl Leerzeichen entfernen


  if (!String.IsNullOrEmpty(s))
  {

      // Hier noch der Vergleich der Variablen
      // Trim, um Leerzeilen am Anfang und Ende der Thema TextBox zu entfernen
      if (s.Contains("%THEMA%")) s = s.Replace("%THEMA%", boxThema.Text.Trim());
      // usw ...

      if (String.IsNullOrEmpty(lastLine)) stringBuilder.AppendLine(); // Leere Zeile einfügen
      stringBuilder.AppendLine(s); // Text einfügen
  }
  lastLine = s;
}

// Text wieder reinschreiben und Leerzeichen löschen
boxZusammenfassung.Text = stringBuilder.ToString();                    

1:
2:
3:
4:
5:
6:
7:
8:
9:
10:

            //VARIABLE %THEMA% ersetzen
            if (!String.IsNullOrEmpty(txt_thema.Text))
            {
                //VARIABLE mit TextBox Text ersetzen
                textvorlage.Text = textvorlage.Text.Replace("%THEMA%", txt_thema.Text);
            }
            else
            {
                textvorlage.Text = textvorlage.Text.Replace("%THEMA%", ""); // PLUS DIE X ZEILEN DANACH BIS ZUR NÄCHSTEN VARIABLEN (X = ZEILENUMBRÜCHE NACH DER VARIABLE %THEMA% BIS ZUR NÄCHSTEN VARIABLE
            }                    

1:
2:
3:
4:
5:
6:
7:
8:
9:
10:
11:
12:
13:
14:
15:
16:
17:
18:
19:
20:
21:
22:
23:
24:
25:
26:

StringBuilder stringBuilder = new StringBuilder();

// Alle Zeilen durchgehen und prüfen, ob zwei leere Zeilen hintereinander kommen
// Wenn nein, füge sie zum StringBuilder hinzu

string lastLine = "blabla"; // Darf nicht leer sein, sonst evtl Leerzeile am Anfang des Textes

foreach (string line in boxZusammenfassung.Lines)
{
  string s = line.Trim(); // Evtl Leerzeichen entfernen

  // Hier noch der Vergleich der Variablen
  // Trim, um Leerzeilen am Anfang und Ende der Thema TextBox zu entfernen
  if (s.Contains("%THEMA%")) s = s.Replace("%THEMA%", boxThema.Text.Trim());
  //   usw ...

  if (!String.IsNullOrEmpty(s))
  {
      if (String.IsNullOrEmpty(lastLine)) stringBuilder.AppendLine(); // Leere Zeile einfügen
      stringBuilder.AppendLine(s); // Text einfügen
  }
  lastLine = s;
}

// Text wieder reinschreiben und Leerzeichen löschen
boxZusammenfassung.Text = stringBuilder.ToString();