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struct Kiste
        {
            public int Breite;
            public int Hoehe;
            public int Laenge;
            public bool flag;
        }					

1:

Kiste[] kleineKiste = new Kiste[100];					

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static void Hauptmenu(Kiste[] kleineKiste)
        {
            char auswahl;
            
            Console.WriteLine("----- HAUPTMENÜ -----");
            Console.WriteLine();
            Console.WriteLine("A. Eine neue Kiste erstellen");
            Console.WriteLine("B. Eine Kiste löschen");
            Console.WriteLine("C. Eine Kiste ändern");
            Console.WriteLine("D. Eine Kiste anzeigen");
            Console.WriteLine("E. Alle Kiste auflisten");
            Console.WriteLine();
            Console.Write("Wählen Sie ein Menü aus: ");

            auswahl = Convert.ToChar(Console.ReadLine());

            switch (auswahl)
            {
                case 'A':
                case 'a':

                    Console.Clear();

                    for (int index = 1; index < kleineKiste.Length; index++)
                    {
                        Console.Write("Geben Sie die Breite der {0}. Kiste ein: ", index);
                        kleineKiste[index].Breite = Convert.ToInt32(Console.ReadLine());

                        Console.Write("Geben Sie die Höhe der {0}. Kiste ein: ", index);
                        kleineKiste[index].Hoehe = Convert.ToInt32(Console.ReadLine());

                        Console.Write("Geben Sie bitte die Länge der {0}. Kiste ein: ", index);
                        kleineKiste[index].Laenge = Convert.ToInt32(Console.ReadLine());
                    }

                    Hauptmenu(kleineKiste);
                    break;					

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4:

mache
  nächste Abfrage
  switch
bis Ende gewünscht					

1:
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int value;
if( int.TryParse( Console.ReadLine(), out value ) {...}					

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// irgendwo beim Programmstart
int lastIndex = -1;   // d.h. es wurde noch nichts bearbeitet

// beim Aufruf der Schleife:
for(int x1 = lastIndex + 1; x1 < 100; x1++) { ... }